Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ArxO35085 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ArxO35085 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ArxO35085 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ArxO35085 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ArxO35085 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ArxO35085 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ArxO35085 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ArxO35085 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ArxO35085 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ArxO35085 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ArxO35085 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ArxO35085 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ArxO35085 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ArxO35085 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ArxO35085 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ArxO35085 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ArxO35085 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ArxO35085 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ArxO35085 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ArxO35085 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ArxO35085 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ArxO35085 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ArxO35085 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ArxO35085 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ArxO35085 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ArxO35085 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ArxO35085 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ArxO35085 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ArxO35085 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ArxO35085 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ArxO35085 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ArxO35085 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ArxO35085 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ArxO35085 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ArxO35085 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ArxO35085 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ArxO35085 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ArxO35085 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ArxO35085 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ArxO35085 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ArxO35085 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ArxO35085 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ArxO35085 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ArxO35085 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ArxO35085 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ArxO35085 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ArxO35085 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ArxO35085 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ArxO35085 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ArxO35085 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ArxO35085 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ArxO35085 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ArxO35085 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ArxO35085 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ArxO35085 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ArxO35085 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ArxO35085 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ArxO35085 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ArxO35085 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ArxO35085 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ArxO35085 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ArxO35085 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ArxO35085 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ArxO35085 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ArxO35085 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ArxO35085 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ArxO35085 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ArxO35085 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ArxO35085 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ArxO35085 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ArxO35085 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ArxO35085 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ArxO35085 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ArxO35085 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ArxO35085 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ArxO35085 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ArxO35085 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ArxO35085 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ArxO35085 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ArxO35085 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ArxO35085 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ArxO35085 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ArxO35085 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ArxO35085 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ArxO35085 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ArxO35085 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ArxO35085 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ArxO35085 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ArxO35085 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ArxO35085 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ArxO35085 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ArxO35085 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ArxO35085 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ArxO35085 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ArxO35085 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ArxO35085 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ArxO35085 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ArxO35085 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ArxO35085 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms