Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn4O35054 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn4O35054 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn4O35054 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn4O35054 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn4O35054 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn4O35054 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn4O35054 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn4O35054 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn4O35054 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn4O35054 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn4O35054 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn4O35054 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn4O35054 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn4O35054 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn4O35054 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn4O35054 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn4O35054 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn4O35054 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn4O35054 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cldn4O35054 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cldn4O35054 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cldn4O35054 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cldn4O35054 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn4O35054 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn4O35054 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn4O35054 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn4O35054 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn4O35054 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn4O35054 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn4O35054 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn4O35054 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn4O35054 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn4O35054 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn4O35054 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn4O35054 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn4O35054 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn4O35054 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn4O35054 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn4O35054 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn4O35054 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn4O35054 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn4O35054 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn4O35054 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn4O35054 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn4O35054 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn4O35054 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn4O35054 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn4O35054 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn4O35054 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn4O35054 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn4O35054 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn4O35054 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn4O35054 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn4O35054 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn4O35054 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn4O35054 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn4O35054 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn4O35054 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn4O35054 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn4O35054 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn4O35054 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn4O35054 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn4O35054 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn4O35054 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn4O35054 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn4O35054 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn4O35054 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn4O35054 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cldn4O35054 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cldn4O35054 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cldn4O35054 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cldn4O35054 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cldn4O35054 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cldn4O35054 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn4O35054 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn4O35054 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn4O35054 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn4O35054 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn4O35054 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn4O35054 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn4O35054 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn4O35054 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn4O35054 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn4O35054 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn4O35054 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn4O35054 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn4O35054 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn4O35054 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn4O35054 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn4O35054 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn4O35054 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn4O35054 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn4O35054 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn4O35054 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn4O35054 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn4O35054 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn4O35054 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn4O35054 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn4O35054 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms