Protein–RNA interactions for Protein: O09126

Sema4d, Semaphorin-4D, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4dO09126 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sema4dO09126 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms