Protein–RNA interactions for Protein: O08999

Ltbp2, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp2O08999 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ltbp2O08999 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ltbp2O08999 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ltbp2O08999 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ltbp2O08999 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ltbp2O08999 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ltbp2O08999 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ltbp2O08999 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ltbp2O08999 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ltbp2O08999 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ltbp2O08999 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ltbp2O08999 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ltbp2O08999 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ltbp2O08999 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ltbp2O08999 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ltbp2O08999 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ltbp2O08999 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ltbp2O08999 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ltbp2O08999 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ltbp2O08999 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ltbp2O08999 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ltbp2O08999 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ltbp2O08999 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ltbp2O08999 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ltbp2O08999 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ltbp2O08999 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ltbp2O08999 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ltbp2O08999 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ltbp2O08999 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ltbp2O08999 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ltbp2O08999 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ltbp2O08999 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ltbp2O08999 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ltbp2O08999 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ltbp2O08999 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ltbp2O08999 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ltbp2O08999 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ltbp2O08999 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ltbp2O08999 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ltbp2O08999 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ltbp2O08999 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ltbp2O08999 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ltbp2O08999 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ltbp2O08999 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ltbp2O08999 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ltbp2O08999 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ltbp2O08999 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ltbp2O08999 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ltbp2O08999 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ltbp2O08999 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ltbp2O08999 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ltbp2O08999 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ltbp2O08999 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ltbp2O08999 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ltbp2O08999 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ltbp2O08999 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ltbp2O08999 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ltbp2O08999 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ltbp2O08999 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ltbp2O08999 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ltbp2O08999 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ltbp2O08999 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ltbp2O08999 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ltbp2O08999 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ltbp2O08999 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ltbp2O08999 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ltbp2O08999 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ltbp2O08999 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ltbp2O08999 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ltbp2O08999 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ltbp2O08999 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ltbp2O08999 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ltbp2O08999 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ltbp2O08999 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ltbp2O08999 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ltbp2O08999 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ltbp2O08999 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ltbp2O08999 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ltbp2O08999 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ltbp2O08999 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ltbp2O08999 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ltbp2O08999 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ltbp2O08999 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ltbp2O08999 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ltbp2O08999 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ltbp2O08999 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ltbp2O08999 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ltbp2O08999 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ltbp2O08999 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ltbp2O08999 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ltbp2O08999 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ltbp2O08999 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ltbp2O08999 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ltbp2O08999 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ltbp2O08999 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ltbp2O08999 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ltbp2O08999 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ltbp2O08999 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ltbp2O08999 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ltbp2O08999 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms