Protein–RNA interactions for Protein: O08750

Nfil3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfil3O08750 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nfil3O08750 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nfil3O08750 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nfil3O08750 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nfil3O08750 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nfil3O08750 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nfil3O08750 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nfil3O08750 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nfil3O08750 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nfil3O08750 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nfil3O08750 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nfil3O08750 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nfil3O08750 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nfil3O08750 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nfil3O08750 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nfil3O08750 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Nfil3O08750 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nfil3O08750 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nfil3O08750 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nfil3O08750 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nfil3O08750 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nfil3O08750 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nfil3O08750 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nfil3O08750 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nfil3O08750 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nfil3O08750 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nfil3O08750 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nfil3O08750 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Nfil3O08750 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nfil3O08750 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nfil3O08750 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nfil3O08750 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nfil3O08750 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nfil3O08750 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nfil3O08750 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nfil3O08750 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nfil3O08750 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nfil3O08750 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nfil3O08750 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nfil3O08750 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nfil3O08750 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Nfil3O08750 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nfil3O08750 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nfil3O08750 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nfil3O08750 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms