Protein–RNA interactions for Protein: O08574

Mesp2, Mesoderm posterior protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp2O08574 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mesp2O08574 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mesp2O08574 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mesp2O08574 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mesp2O08574 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mesp2O08574 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mesp2O08574 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mesp2O08574 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mesp2O08574 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mesp2O08574 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mesp2O08574 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mesp2O08574 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mesp2O08574 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mesp2O08574 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mesp2O08574 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mesp2O08574 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mesp2O08574 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mesp2O08574 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mesp2O08574 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mesp2O08574 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mesp2O08574 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mesp2O08574 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Mesp2O08574 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mesp2O08574 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mesp2O08574 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mesp2O08574 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mesp2O08574 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mesp2O08574 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mesp2O08574 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mesp2O08574 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mesp2O08574 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mesp2O08574 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mesp2O08574 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mesp2O08574 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mesp2O08574 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mesp2O08574 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mesp2O08574 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mesp2O08574 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mesp2O08574 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms