Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Efna5O08543 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Efna5O08543 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Efna5O08543 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Efna5O08543 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Efna5O08543 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Efna5O08543 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Efna5O08543 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Efna5O08543 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Efna5O08543 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Efna5O08543 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Efna5O08543 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Efna5O08543 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Efna5O08543 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Efna5O08543 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Efna5O08543 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Efna5O08543 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Efna5O08543 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Efna5O08543 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Efna5O08543 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Efna5O08543 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Efna5O08543 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Efna5O08543 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Efna5O08543 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Efna5O08543 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Efna5O08543 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Efna5O08543 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Efna5O08543 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Efna5O08543 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Efna5O08543 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Efna5O08543 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Efna5O08543 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Efna5O08543 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Efna5O08543 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Efna5O08543 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Efna5O08543 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Efna5O08543 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Efna5O08543 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Efna5O08543 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Efna5O08543 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Efna5O08543 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Efna5O08543 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Efna5O08543 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Efna5O08543 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Efna5O08543 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Efna5O08543 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Efna5O08543 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Efna5O08543 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Efna5O08543 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Efna5O08543 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Efna5O08543 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Efna5O08543 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Efna5O08543 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Efna5O08543 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Efna5O08543 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Efna5O08543 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Efna5O08543 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Efna5O08543 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Efna5O08543 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Efna5O08543 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Efna5O08543 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Efna5O08543 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Efna5O08543 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Efna5O08543 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Efna5O08543 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Efna5O08543 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Efna5O08543 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Efna5O08543 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Efna5O08543 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Efna5O08543 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms