Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp35M0QWN7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp35M0QWN7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp35M0QWN7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp35M0QWN7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp35M0QWN7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp35M0QWN7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp35M0QWN7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp35M0QWN7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp35M0QWN7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp35M0QWN7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp35M0QWN7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp35M0QWN7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp35M0QWN7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp35M0QWN7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp35M0QWN7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp35M0QWN7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp35M0QWN7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp35M0QWN7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp35M0QWN7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp35M0QWN7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp35M0QWN7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp35M0QWN7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp35M0QWN7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp35M0QWN7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp35M0QWN7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp35M0QWN7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp35M0QWN7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp35M0QWN7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp35M0QWN7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp35M0QWN7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp35M0QWN7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp35M0QWN7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp35M0QWN7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp35M0QWN7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp35M0QWN7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp35M0QWN7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp35M0QWN7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp35M0QWN7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp35M0QWN7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp35M0QWN7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp35M0QWN7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp35M0QWN7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp35M0QWN7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp35M0QWN7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp35M0QWN7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp35M0QWN7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp35M0QWN7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp35M0QWN7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp35M0QWN7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp35M0QWN7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp35M0QWN7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp35M0QWN7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp35M0QWN7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp35M0QWN7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp35M0QWN7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp35M0QWN7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp35M0QWN7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp35M0QWN7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp35M0QWN7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp35M0QWN7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp35M0QWN7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp35M0QWN7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp35M0QWN7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp35M0QWN7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp35M0QWN7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp35M0QWN7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp35M0QWN7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp35M0QWN7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp35M0QWN7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp35M0QWN7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp35M0QWN7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp35M0QWN7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp35M0QWN7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp35M0QWN7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp35M0QWN7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp35M0QWN7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp35M0QWN7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp35M0QWN7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp35M0QWN7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp35M0QWN7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp35M0QWN7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp35M0QWN7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp35M0QWN7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp35M0QWN7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp35M0QWN7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp35M0QWN7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp35M0QWN7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp35M0QWN7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp35M0QWN7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp35M0QWN7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp35M0QWN7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp35M0QWN7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp35M0QWN7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp35M0QWN7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp35M0QWN7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp35M0QWN7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp35M0QWN7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp35M0QWN7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp35M0QWN7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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