Protein–RNA interactions for Protein: L7N248

Gm6871, Predicted gene 6871, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6871L7N248 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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