Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm20939L7N243 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms