Protein–RNA interactions for Protein: L7N1W8

Vmn2r88, Vomeronasal 2, receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r88L7N1W8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn2r88L7N1W8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn2r88L7N1W8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn2r88L7N1W8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn2r88L7N1W8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn2r88L7N1W8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn2r88L7N1W8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn2r88L7N1W8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn2r88L7N1W8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn2r88L7N1W8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn2r88L7N1W8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn2r88L7N1W8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn2r88L7N1W8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn2r88L7N1W8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn2r88L7N1W8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn2r88L7N1W8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn2r88L7N1W8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn2r88L7N1W8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn2r88L7N1W8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn2r88L7N1W8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn2r88L7N1W8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn2r88L7N1W8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn2r88L7N1W8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn2r88L7N1W8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn2r88L7N1W8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn2r88L7N1W8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn2r88L7N1W8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn2r88L7N1W8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn2r88L7N1W8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn2r88L7N1W8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn2r88L7N1W8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn2r88L7N1W8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn2r88L7N1W8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vmn2r88L7N1W8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vmn2r88L7N1W8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn2r88L7N1W8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms