Protein–RNA interactions for Protein: J3QP07

B020004C17Rik, RIKEN cDNA B020004C17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B020004C17RikJ3QP07 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
B020004C17RikJ3QP07 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
B020004C17RikJ3QP07 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
B020004C17RikJ3QP07 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
B020004C17RikJ3QP07 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
B020004C17RikJ3QP07 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
B020004C17RikJ3QP07 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
B020004C17RikJ3QP07 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
B020004C17RikJ3QP07 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
B020004C17RikJ3QP07 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
B020004C17RikJ3QP07 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
B020004C17RikJ3QP07 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
B020004C17RikJ3QP07 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
B020004C17RikJ3QP07 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
B020004C17RikJ3QP07 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
B020004C17RikJ3QP07 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
B020004C17RikJ3QP07 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
B020004C17RikJ3QP07 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
B020004C17RikJ3QP07 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
B020004C17RikJ3QP07 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
B020004C17RikJ3QP07 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
B020004C17RikJ3QP07 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
B020004C17RikJ3QP07 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
B020004C17RikJ3QP07 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
B020004C17RikJ3QP07 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
B020004C17RikJ3QP07 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
B020004C17RikJ3QP07 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
B020004C17RikJ3QP07 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
B020004C17RikJ3QP07 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
B020004C17RikJ3QP07 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
B020004C17RikJ3QP07 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
B020004C17RikJ3QP07 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
B020004C17RikJ3QP07 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
B020004C17RikJ3QP07 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
B020004C17RikJ3QP07 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
B020004C17RikJ3QP07 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
B020004C17RikJ3QP07 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
B020004C17RikJ3QP07 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
B020004C17RikJ3QP07 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
B020004C17RikJ3QP07 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
B020004C17RikJ3QP07 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
B020004C17RikJ3QP07 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
B020004C17RikJ3QP07 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
B020004C17RikJ3QP07 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
B020004C17RikJ3QP07 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
B020004C17RikJ3QP07 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
B020004C17RikJ3QP07 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
B020004C17RikJ3QP07 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
B020004C17RikJ3QP07 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
B020004C17RikJ3QP07 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
B020004C17RikJ3QP07 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
B020004C17RikJ3QP07 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
B020004C17RikJ3QP07 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
B020004C17RikJ3QP07 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
B020004C17RikJ3QP07 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
B020004C17RikJ3QP07 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
B020004C17RikJ3QP07 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
B020004C17RikJ3QP07 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
B020004C17RikJ3QP07 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
B020004C17RikJ3QP07 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
B020004C17RikJ3QP07 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
B020004C17RikJ3QP07 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
B020004C17RikJ3QP07 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
B020004C17RikJ3QP07 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
B020004C17RikJ3QP07 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
B020004C17RikJ3QP07 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
B020004C17RikJ3QP07 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
B020004C17RikJ3QP07 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
B020004C17RikJ3QP07 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
B020004C17RikJ3QP07 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
B020004C17RikJ3QP07 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
B020004C17RikJ3QP07 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
B020004C17RikJ3QP07 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
B020004C17RikJ3QP07 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
B020004C17RikJ3QP07 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
B020004C17RikJ3QP07 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
B020004C17RikJ3QP07 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
B020004C17RikJ3QP07 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
B020004C17RikJ3QP07 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
B020004C17RikJ3QP07 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
B020004C17RikJ3QP07 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
B020004C17RikJ3QP07 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
B020004C17RikJ3QP07 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
B020004C17RikJ3QP07 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
B020004C17RikJ3QP07 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
B020004C17RikJ3QP07 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
B020004C17RikJ3QP07 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
B020004C17RikJ3QP07 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
B020004C17RikJ3QP07 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
B020004C17RikJ3QP07 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
B020004C17RikJ3QP07 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
B020004C17RikJ3QP07 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
B020004C17RikJ3QP07 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
B020004C17RikJ3QP07 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
B020004C17RikJ3QP07 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
B020004C17RikJ3QP07 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
B020004C17RikJ3QP07 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
B020004C17RikJ3QP07 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
B020004C17RikJ3QP07 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
B020004C17RikJ3QP07 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms