Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Gm17577J3QNF7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Gm17577J3QNF7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm17577J3QNF7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17577J3QNF7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17577J3QNF7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17577J3QNF7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17577J3QNF7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17577J3QNF7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17577J3QNF7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17577J3QNF7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17577J3QNF7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17577J3QNF7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17577J3QNF7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17577J3QNF7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17577J3QNF7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17577J3QNF7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17577J3QNF7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17577J3QNF7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17577J3QNF7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17577J3QNF7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17577J3QNF7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17577J3QNF7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17577J3QNF7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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