Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tubgcp6G5E8P0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Tubgcp6G5E8P0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tubgcp6G5E8P0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tubgcp6G5E8P0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tubgcp6G5E8P0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tubgcp6G5E8P0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tubgcp6G5E8P0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Tubgcp6G5E8P0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tubgcp6G5E8P0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tubgcp6G5E8P0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Tubgcp6G5E8P0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tubgcp6G5E8P0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tubgcp6G5E8P0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tubgcp6G5E8P0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tubgcp6G5E8P0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tubgcp6G5E8P0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tubgcp6G5E8P0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tubgcp6G5E8P0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tubgcp6G5E8P0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tubgcp6G5E8P0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tubgcp6G5E8P0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tubgcp6G5E8P0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tubgcp6G5E8P0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Tubgcp6G5E8P0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Tubgcp6G5E8P0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tubgcp6G5E8P0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Tubgcp6G5E8P0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tubgcp6G5E8P0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tubgcp6G5E8P0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tubgcp6G5E8P0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tubgcp6G5E8P0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tubgcp6G5E8P0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tubgcp6G5E8P0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tubgcp6G5E8P0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tubgcp6G5E8P0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tubgcp6G5E8P0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Tubgcp6G5E8P0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tubgcp6G5E8P0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Tubgcp6G5E8P0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tubgcp6G5E8P0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tubgcp6G5E8P0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tubgcp6G5E8P0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tubgcp6G5E8P0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Tubgcp6G5E8P0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tubgcp6G5E8P0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tubgcp6G5E8P0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tubgcp6G5E8P0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tubgcp6G5E8P0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tubgcp6G5E8P0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tubgcp6G5E8P0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tubgcp6G5E8P0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tubgcp6G5E8P0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tubgcp6G5E8P0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tubgcp6G5E8P0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tubgcp6G5E8P0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tubgcp6G5E8P0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tubgcp6G5E8P0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tubgcp6G5E8P0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tubgcp6G5E8P0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Tubgcp6G5E8P0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tubgcp6G5E8P0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tubgcp6G5E8P0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tubgcp6G5E8P0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tubgcp6G5E8P0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tubgcp6G5E8P0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Tubgcp6G5E8P0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tubgcp6G5E8P0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tubgcp6G5E8P0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tubgcp6G5E8P0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Tubgcp6G5E8P0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Tubgcp6G5E8P0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Tubgcp6G5E8P0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Tubgcp6G5E8P0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Tubgcp6G5E8P0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tubgcp6G5E8P0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tubgcp6G5E8P0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tubgcp6G5E8P0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tubgcp6G5E8P0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Tubgcp6G5E8P0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tubgcp6G5E8P0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tubgcp6G5E8P0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tubgcp6G5E8P0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Tubgcp6G5E8P0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tubgcp6G5E8P0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tubgcp6G5E8P0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tubgcp6G5E8P0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tubgcp6G5E8P0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tubgcp6G5E8P0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tubgcp6G5E8P0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tubgcp6G5E8P0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tubgcp6G5E8P0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tubgcp6G5E8P0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tubgcp6G5E8P0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tubgcp6G5E8P0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tubgcp6G5E8P0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tubgcp6G5E8P0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tubgcp6G5E8P0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tubgcp6G5E8P0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tubgcp6G5E8P0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms