Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G1

Vmn1r12, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r12G5E8G1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r12G5E8G1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vmn1r12G5E8G1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms