Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

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Length 688 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sclt1G5E861 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sclt1G5E861 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sclt1G5E861 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Sclt1G5E861 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sclt1G5E861 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sclt1G5E861 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sclt1G5E861 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sclt1G5E861 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sclt1G5E861 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sclt1G5E861 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sclt1G5E861 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sclt1G5E861 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sclt1G5E861 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sclt1G5E861 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sclt1G5E861 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sclt1G5E861 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sclt1G5E861 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sclt1G5E861 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sclt1G5E861 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sclt1G5E861 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sclt1G5E861 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sclt1G5E861 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sclt1G5E861 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sclt1G5E861 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sclt1G5E861 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Sclt1G5E861 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sclt1G5E861 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sclt1G5E861 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sclt1G5E861 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sclt1G5E861 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sclt1G5E861 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sclt1G5E861 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sclt1G5E861 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sclt1G5E861 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sclt1G5E861 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sclt1G5E861 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Sclt1G5E861 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sclt1G5E861 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sclt1G5E861 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sclt1G5E861 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sclt1G5E861 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sclt1G5E861 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sclt1G5E861 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sclt1G5E861 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sclt1G5E861 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sclt1G5E861 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sclt1G5E861 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sclt1G5E861 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sclt1G5E861 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sclt1G5E861 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sclt1G5E861 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sclt1G5E861 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sclt1G5E861 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sclt1G5E861 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sclt1G5E861 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sclt1G5E861 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sclt1G5E861 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sclt1G5E861 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sclt1G5E861 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sclt1G5E861 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sclt1G5E861 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sclt1G5E861 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sclt1G5E861 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sclt1G5E861 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sclt1G5E861 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sclt1G5E861 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sclt1G5E861 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sclt1G5E861 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sclt1G5E861 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sclt1G5E861 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sclt1G5E861 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sclt1G5E861 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sclt1G5E861 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms