Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Arfgef1G3X9K3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Arfgef1G3X9K3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Arfgef1G3X9K3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Arfgef1G3X9K3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Arfgef1G3X9K3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Arfgef1G3X9K3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Arfgef1G3X9K3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Arfgef1G3X9K3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Arfgef1G3X9K3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Arfgef1G3X9K3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Arfgef1G3X9K3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Arfgef1G3X9K3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Arfgef1G3X9K3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Arfgef1G3X9K3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Arfgef1G3X9K3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Arfgef1G3X9K3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Arfgef1G3X9K3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Arfgef1G3X9K3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Arfgef1G3X9K3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Arfgef1G3X9K3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Arfgef1G3X9K3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Arfgef1G3X9K3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Arfgef1G3X9K3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Arfgef1G3X9K3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Arfgef1G3X9K3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Arfgef1G3X9K3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Arfgef1G3X9K3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Arfgef1G3X9K3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Arfgef1G3X9K3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Arfgef1G3X9K3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Arfgef1G3X9K3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Arfgef1G3X9K3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Arfgef1G3X9K3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Arfgef1G3X9K3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Arfgef1G3X9K3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Arfgef1G3X9K3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Arfgef1G3X9K3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Arfgef1G3X9K3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Arfgef1G3X9K3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Arfgef1G3X9K3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Arfgef1G3X9K3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Arfgef1G3X9K3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Arfgef1G3X9K3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Arfgef1G3X9K3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Arfgef1G3X9K3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Arfgef1G3X9K3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Arfgef1G3X9K3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Arfgef1G3X9K3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Arfgef1G3X9K3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Arfgef1G3X9K3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Arfgef1G3X9K3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Arfgef1G3X9K3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Arfgef1G3X9K3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Arfgef1G3X9K3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Arfgef1G3X9K3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Arfgef1G3X9K3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Arfgef1G3X9K3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Arfgef1G3X9K3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Arfgef1G3X9K3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Arfgef1G3X9K3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Arfgef1G3X9K3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Arfgef1G3X9K3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Arfgef1G3X9K3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Arfgef1G3X9K3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Arfgef1G3X9K3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Arfgef1G3X9K3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Arfgef1G3X9K3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Arfgef1G3X9K3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Arfgef1G3X9K3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Arfgef1G3X9K3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Arfgef1G3X9K3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Arfgef1G3X9K3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Arfgef1G3X9K3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Arfgef1G3X9K3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Arfgef1G3X9K3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Arfgef1G3X9K3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Arfgef1G3X9K3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Arfgef1G3X9K3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Arfgef1G3X9K3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Arfgef1G3X9K3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Arfgef1G3X9K3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Arfgef1G3X9K3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Arfgef1G3X9K3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Arfgef1G3X9K3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Arfgef1G3X9K3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Arfgef1G3X9K3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Arfgef1G3X9K3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Arfgef1G3X9K3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Arfgef1G3X9K3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Arfgef1G3X9K3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Arfgef1G3X9K3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Arfgef1G3X9K3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Arfgef1G3X9K3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Arfgef1G3X9K3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Arfgef1G3X9K3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Arfgef1G3X9K3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Arfgef1G3X9K3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Arfgef1G3X9K3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Arfgef1G3X9K3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms