Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sh3tc1G3X9F6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sh3tc1G3X9F6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sh3tc1G3X9F6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sh3tc1G3X9F6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sh3tc1G3X9F6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sh3tc1G3X9F6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sh3tc1G3X9F6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sh3tc1G3X9F6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sh3tc1G3X9F6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sh3tc1G3X9F6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sh3tc1G3X9F6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sh3tc1G3X9F6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sh3tc1G3X9F6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sh3tc1G3X9F6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sh3tc1G3X9F6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sh3tc1G3X9F6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sh3tc1G3X9F6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sh3tc1G3X9F6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sh3tc1G3X9F6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sh3tc1G3X9F6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sh3tc1G3X9F6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sh3tc1G3X9F6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sh3tc1G3X9F6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sh3tc1G3X9F6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sh3tc1G3X9F6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sh3tc1G3X9F6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sh3tc1G3X9F6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sh3tc1G3X9F6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sh3tc1G3X9F6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sh3tc1G3X9F6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sh3tc1G3X9F6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sh3tc1G3X9F6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sh3tc1G3X9F6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sh3tc1G3X9F6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sh3tc1G3X9F6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sh3tc1G3X9F6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sh3tc1G3X9F6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sh3tc1G3X9F6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sh3tc1G3X9F6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sh3tc1G3X9F6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sh3tc1G3X9F6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sh3tc1G3X9F6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sh3tc1G3X9F6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sh3tc1G3X9F6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sh3tc1G3X9F6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sh3tc1G3X9F6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sh3tc1G3X9F6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sh3tc1G3X9F6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sh3tc1G3X9F6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sh3tc1G3X9F6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sh3tc1G3X9F6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sh3tc1G3X9F6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sh3tc1G3X9F6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sh3tc1G3X9F6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sh3tc1G3X9F6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sh3tc1G3X9F6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sh3tc1G3X9F6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sh3tc1G3X9F6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sh3tc1G3X9F6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Sh3tc1G3X9F6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sh3tc1G3X9F6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sh3tc1G3X9F6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sh3tc1G3X9F6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sh3tc1G3X9F6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sh3tc1G3X9F6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sh3tc1G3X9F6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sh3tc1G3X9F6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sh3tc1G3X9F6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sh3tc1G3X9F6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sh3tc1G3X9F6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Sh3tc1G3X9F6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sh3tc1G3X9F6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sh3tc1G3X9F6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sh3tc1G3X9F6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Sh3tc1G3X9F6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Sh3tc1G3X9F6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sh3tc1G3X9F6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sh3tc1G3X9F6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sh3tc1G3X9F6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sh3tc1G3X9F6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sh3tc1G3X9F6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sh3tc1G3X9F6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sh3tc1G3X9F6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sh3tc1G3X9F6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sh3tc1G3X9F6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sh3tc1G3X9F6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sh3tc1G3X9F6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sh3tc1G3X9F6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sh3tc1G3X9F6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sh3tc1G3X9F6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Sh3tc1G3X9F6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sh3tc1G3X9F6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sh3tc1G3X9F6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sh3tc1G3X9F6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sh3tc1G3X9F6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sh3tc1G3X9F6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sh3tc1G3X9F6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Sh3tc1G3X9F6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sh3tc1G3X9F6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms