Protein–RNA interactions for Protein: G3X9B4

4933408B17Rik, MCG121508, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933408B17RikG3X9B4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933408B17RikG3X9B4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933408B17RikG3X9B4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933408B17RikG3X9B4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933408B17RikG3X9B4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933408B17RikG3X9B4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933408B17RikG3X9B4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933408B17RikG3X9B4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
4933408B17RikG3X9B4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933408B17RikG3X9B4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933408B17RikG3X9B4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933408B17RikG3X9B4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
4933408B17RikG3X9B4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933408B17RikG3X9B4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933408B17RikG3X9B4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933408B17RikG3X9B4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933408B17RikG3X9B4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933408B17RikG3X9B4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933408B17RikG3X9B4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933408B17RikG3X9B4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4933408B17RikG3X9B4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
4933408B17RikG3X9B4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
4933408B17RikG3X9B4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
4933408B17RikG3X9B4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
4933408B17RikG3X9B4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms