Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Chrna9G3X8Z7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chrna9G3X8Z7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chrna9G3X8Z7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chrna9G3X8Z7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chrna9G3X8Z7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chrna9G3X8Z7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chrna9G3X8Z7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chrna9G3X8Z7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chrna9G3X8Z7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chrna9G3X8Z7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Chrna9G3X8Z7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chrna9G3X8Z7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Chrna9G3X8Z7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chrna9G3X8Z7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chrna9G3X8Z7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chrna9G3X8Z7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chrna9G3X8Z7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chrna9G3X8Z7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chrna9G3X8Z7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chrna9G3X8Z7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chrna9G3X8Z7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chrna9G3X8Z7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chrna9G3X8Z7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Chrna9G3X8Z7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chrna9G3X8Z7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chrna9G3X8Z7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chrna9G3X8Z7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chrna9G3X8Z7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chrna9G3X8Z7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chrna9G3X8Z7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chrna9G3X8Z7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chrna9G3X8Z7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chrna9G3X8Z7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chrna9G3X8Z7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chrna9G3X8Z7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chrna9G3X8Z7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chrna9G3X8Z7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chrna9G3X8Z7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chrna9G3X8Z7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chrna9G3X8Z7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Chrna9G3X8Z7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chrna9G3X8Z7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chrna9G3X8Z7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chrna9G3X8Z7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chrna9G3X8Z7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chrna9G3X8Z7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chrna9G3X8Z7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Chrna9G3X8Z7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chrna9G3X8Z7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chrna9G3X8Z7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chrna9G3X8Z7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chrna9G3X8Z7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chrna9G3X8Z7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chrna9G3X8Z7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chrna9G3X8Z7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chrna9G3X8Z7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chrna9G3X8Z7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chrna9G3X8Z7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chrna9G3X8Z7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chrna9G3X8Z7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chrna9G3X8Z7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chrna9G3X8Z7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chrna9G3X8Z7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chrna9G3X8Z7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chrna9G3X8Z7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chrna9G3X8Z7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chrna9G3X8Z7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chrna9G3X8Z7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chrna9G3X8Z7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chrna9G3X8Z7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Chrna9G3X8Z7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Chrna9G3X8Z7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chrna9G3X8Z7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chrna9G3X8Z7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chrna9G3X8Z7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chrna9G3X8Z7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chrna9G3X8Z7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chrna9G3X8Z7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chrna9G3X8Z7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chrna9G3X8Z7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chrna9G3X8Z7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chrna9G3X8Z7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chrna9G3X8Z7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chrna9G3X8Z7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chrna9G3X8Z7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chrna9G3X8Z7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chrna9G3X8Z7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chrna9G3X8Z7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chrna9G3X8Z7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Chrna9G3X8Z7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chrna9G3X8Z7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chrna9G3X8Z7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chrna9G3X8Z7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chrna9G3X8Z7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chrna9G3X8Z7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chrna9G3X8Z7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chrna9G3X8Z7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chrna9G3X8Z7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chrna9G3X8Z7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms