Protein–RNA interactions for Protein: G3X8R9

Tmigd3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd3G3X8R9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmigd3G3X8R9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmigd3G3X8R9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tmigd3G3X8R9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmigd3G3X8R9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmigd3G3X8R9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmigd3G3X8R9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmigd3G3X8R9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmigd3G3X8R9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmigd3G3X8R9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmigd3G3X8R9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmigd3G3X8R9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmigd3G3X8R9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmigd3G3X8R9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmigd3G3X8R9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmigd3G3X8R9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmigd3G3X8R9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmigd3G3X8R9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmigd3G3X8R9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmigd3G3X8R9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmigd3G3X8R9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmigd3G3X8R9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmigd3G3X8R9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmigd3G3X8R9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmigd3G3X8R9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmigd3G3X8R9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmigd3G3X8R9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmigd3G3X8R9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmigd3G3X8R9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmigd3G3X8R9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmigd3G3X8R9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmigd3G3X8R9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmigd3G3X8R9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmigd3G3X8R9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmigd3G3X8R9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmigd3G3X8R9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmigd3G3X8R9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmigd3G3X8R9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmigd3G3X8R9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmigd3G3X8R9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmigd3G3X8R9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmigd3G3X8R9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmigd3G3X8R9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmigd3G3X8R9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmigd3G3X8R9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmigd3G3X8R9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmigd3G3X8R9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmigd3G3X8R9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmigd3G3X8R9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmigd3G3X8R9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmigd3G3X8R9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmigd3G3X8R9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Tmigd3G3X8R9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmigd3G3X8R9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmigd3G3X8R9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmigd3G3X8R9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmigd3G3X8R9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmigd3G3X8R9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmigd3G3X8R9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmigd3G3X8R9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmigd3G3X8R9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmigd3G3X8R9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmigd3G3X8R9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmigd3G3X8R9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmigd3G3X8R9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmigd3G3X8R9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmigd3G3X8R9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmigd3G3X8R9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmigd3G3X8R9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmigd3G3X8R9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmigd3G3X8R9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmigd3G3X8R9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmigd3G3X8R9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmigd3G3X8R9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmigd3G3X8R9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmigd3G3X8R9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmigd3G3X8R9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmigd3G3X8R9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmigd3G3X8R9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmigd3G3X8R9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmigd3G3X8R9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmigd3G3X8R9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmigd3G3X8R9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmigd3G3X8R9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmigd3G3X8R9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmigd3G3X8R9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmigd3G3X8R9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmigd3G3X8R9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmigd3G3X8R9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmigd3G3X8R9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmigd3G3X8R9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmigd3G3X8R9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmigd3G3X8R9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmigd3G3X8R9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmigd3G3X8R9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmigd3G3X8R9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmigd3G3X8R9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmigd3G3X8R9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmigd3G3X8R9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmigd3G3X8R9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms