Protein–RNA interactions for Protein: F8VPP0

Zfp708, Zinc finger protein 708, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp708F8VPP0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp708F8VPP0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms