Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pagr1bF6V0H0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pagr1bF6V0H0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pagr1bF6V0H0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pagr1bF6V0H0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pagr1bF6V0H0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pagr1bF6V0H0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pagr1bF6V0H0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pagr1bF6V0H0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pagr1bF6V0H0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pagr1bF6V0H0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pagr1bF6V0H0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pagr1bF6V0H0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pagr1bF6V0H0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pagr1bF6V0H0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pagr1bF6V0H0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pagr1bF6V0H0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pagr1bF6V0H0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pagr1bF6V0H0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pagr1bF6V0H0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pagr1bF6V0H0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pagr1bF6V0H0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Pagr1bF6V0H0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pagr1bF6V0H0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pagr1bF6V0H0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pagr1bF6V0H0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pagr1bF6V0H0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pagr1bF6V0H0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pagr1bF6V0H0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pagr1bF6V0H0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pagr1bF6V0H0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pagr1bF6V0H0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pagr1bF6V0H0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pagr1bF6V0H0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pagr1bF6V0H0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pagr1bF6V0H0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pagr1bF6V0H0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pagr1bF6V0H0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pagr1bF6V0H0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pagr1bF6V0H0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pagr1bF6V0H0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pagr1bF6V0H0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pagr1bF6V0H0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pagr1bF6V0H0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pagr1bF6V0H0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pagr1bF6V0H0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pagr1bF6V0H0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pagr1bF6V0H0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pagr1bF6V0H0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pagr1bF6V0H0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pagr1bF6V0H0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pagr1bF6V0H0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pagr1bF6V0H0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pagr1bF6V0H0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pagr1bF6V0H0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pagr1bF6V0H0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pagr1bF6V0H0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pagr1bF6V0H0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pagr1bF6V0H0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pagr1bF6V0H0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pagr1bF6V0H0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Pagr1bF6V0H0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pagr1bF6V0H0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pagr1bF6V0H0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pagr1bF6V0H0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pagr1bF6V0H0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pagr1bF6V0H0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pagr1bF6V0H0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pagr1bF6V0H0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pagr1bF6V0H0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pagr1bF6V0H0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pagr1bF6V0H0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pagr1bF6V0H0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pagr1bF6V0H0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pagr1bF6V0H0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pagr1bF6V0H0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pagr1bF6V0H0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pagr1bF6V0H0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pagr1bF6V0H0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pagr1bF6V0H0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pagr1bF6V0H0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pagr1bF6V0H0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pagr1bF6V0H0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pagr1bF6V0H0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pagr1bF6V0H0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pagr1bF6V0H0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pagr1bF6V0H0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Pagr1bF6V0H0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pagr1bF6V0H0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pagr1bF6V0H0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pagr1bF6V0H0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pagr1bF6V0H0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Pagr1bF6V0H0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pagr1bF6V0H0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pagr1bF6V0H0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pagr1bF6V0H0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pagr1bF6V0H0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pagr1bF6V0H0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pagr1bF6V0H0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Pagr1bF6V0H0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms