Protein–RNA interactions for Protein: F6S200

Plekhg1, Pleckstrin homology domain-containing, family G (with RhoGef domain) member 1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plekhg1F6S200 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Plekhg1F6S200 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Plekhg1F6S200 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Plekhg1F6S200 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Plekhg1F6S200 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Plekhg1F6S200 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Plekhg1F6S200 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Plekhg1F6S200 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Plekhg1F6S200 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Plekhg1F6S200 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Plekhg1F6S200 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Plekhg1F6S200 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Plekhg1F6S200 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Plekhg1F6S200 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Plekhg1F6S200 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Plekhg1F6S200 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Plekhg1F6S200 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Plekhg1F6S200 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Plekhg1F6S200 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Plekhg1F6S200 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Plekhg1F6S200 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Plekhg1F6S200 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Plekhg1F6S200 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Plekhg1F6S200 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Plekhg1F6S200 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Plekhg1F6S200 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Plekhg1F6S200 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Plekhg1F6S200 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Plekhg1F6S200 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Plekhg1F6S200 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Plekhg1F6S200 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Plekhg1F6S200 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Plekhg1F6S200 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Plekhg1F6S200 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Plekhg1F6S200 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Plekhg1F6S200 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Plekhg1F6S200 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Plekhg1F6S200 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Plekhg1F6S200 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Plekhg1F6S200 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Plekhg1F6S200 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Plekhg1F6S200 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Plekhg1F6S200 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Plekhg1F6S200 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Plekhg1F6S200 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Plekhg1F6S200 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Plekhg1F6S200 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Plekhg1F6S200 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Plekhg1F6S200 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Plekhg1F6S200 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Plekhg1F6S200 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Plekhg1F6S200 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Plekhg1F6S200 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Plekhg1F6S200 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Plekhg1F6S200 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Plekhg1F6S200 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Plekhg1F6S200 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Plekhg1F6S200 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Plekhg1F6S200 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Plekhg1F6S200 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Plekhg1F6S200 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Plekhg1F6S200 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Plekhg1F6S200 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Plekhg1F6S200 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Plekhg1F6S200 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Plekhg1F6S200 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Plekhg1F6S200 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Plekhg1F6S200 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Plekhg1F6S200 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Plekhg1F6S200 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Plekhg1F6S200 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC27.57■■■□□ 2
Plekhg1F6S200 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Plekhg1F6S200 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Plekhg1F6S200 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Plekhg1F6S200 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Plekhg1F6S200 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Plekhg1F6S200 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Plekhg1F6S200 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Plekhg1F6S200 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Plekhg1F6S200 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Plekhg1F6S200 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Plekhg1F6S200 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Plekhg1F6S200 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Plekhg1F6S200 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Plekhg1F6S200 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Plekhg1F6S200 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Plekhg1F6S200 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Plekhg1F6S200 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Plekhg1F6S200 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Plekhg1F6S200 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Plekhg1F6S200 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Plekhg1F6S200 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Plekhg1F6S200 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Plekhg1F6S200 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Plekhg1F6S200 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Plekhg1F6S200 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Plekhg1F6S200 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Plekhg1F6S200 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Plekhg1F6S200 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Plekhg1F6S200 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms