Protein–RNA interactions for Protein: F6RXI4

BC067074, cDNA sequence BC067074, mousemouse

Predictions only

Length 2,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC067074F6RXI4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
BC067074F6RXI4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC067074F6RXI4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC067074F6RXI4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC067074F6RXI4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC067074F6RXI4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC067074F6RXI4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC067074F6RXI4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC067074F6RXI4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC067074F6RXI4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC067074F6RXI4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC067074F6RXI4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC067074F6RXI4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC067074F6RXI4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC067074F6RXI4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC067074F6RXI4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC067074F6RXI4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC067074F6RXI4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC067074F6RXI4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC067074F6RXI4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC067074F6RXI4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BC067074F6RXI4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC067074F6RXI4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC067074F6RXI4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC067074F6RXI4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC067074F6RXI4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC067074F6RXI4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC067074F6RXI4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BC067074F6RXI4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC067074F6RXI4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC067074F6RXI4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC067074F6RXI4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC067074F6RXI4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC067074F6RXI4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC067074F6RXI4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC067074F6RXI4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC067074F6RXI4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC067074F6RXI4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC067074F6RXI4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms