Protein–RNA interactions for Protein: E9QAU8

Rnf165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf165E9QAU8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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Rnf165E9QAU8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf165E9QAU8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf165E9QAU8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf165E9QAU8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf165E9QAU8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf165E9QAU8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
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Rnf165E9QAU8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf165E9QAU8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf165E9QAU8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf165E9QAU8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf165E9QAU8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf165E9QAU8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf165E9QAU8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf165E9QAU8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf165E9QAU8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf165E9QAU8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf165E9QAU8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf165E9QAU8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf165E9QAU8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf165E9QAU8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf165E9QAU8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf165E9QAU8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnf165E9QAU8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnf165E9QAU8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnf165E9QAU8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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Rnf165E9QAU8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rnf165E9QAU8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rnf165E9QAU8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf165E9QAU8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf165E9QAU8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf165E9QAU8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf165E9QAU8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf165E9QAU8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf165E9QAU8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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Rnf165E9QAU8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf165E9QAU8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf165E9QAU8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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Rnf165E9QAU8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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Rnf165E9QAU8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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Rnf165E9QAU8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf165E9QAU8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf165E9QAU8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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Rnf165E9QAU8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf165E9QAU8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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Rnf165E9QAU8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf165E9QAU8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf165E9QAU8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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Rnf165E9QAU8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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Rnf165E9QAU8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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Rnf165E9QAU8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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Rnf165E9QAU8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf165E9QAU8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf165E9QAU8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
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Rnf165E9QAU8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rnf165E9QAU8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rnf165E9QAU8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rnf165E9QAU8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rnf165E9QAU8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf165E9QAU8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf165E9QAU8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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Rnf165E9QAU8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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