Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc146E9Q9F7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc146E9Q9F7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc146E9Q9F7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc146E9Q9F7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc146E9Q9F7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc146E9Q9F7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc146E9Q9F7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc146E9Q9F7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc146E9Q9F7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc146E9Q9F7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc146E9Q9F7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc146E9Q9F7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc146E9Q9F7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc146E9Q9F7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc146E9Q9F7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc146E9Q9F7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc146E9Q9F7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc146E9Q9F7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc146E9Q9F7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc146E9Q9F7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc146E9Q9F7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc146E9Q9F7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc146E9Q9F7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc146E9Q9F7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc146E9Q9F7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc146E9Q9F7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc146E9Q9F7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc146E9Q9F7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc146E9Q9F7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc146E9Q9F7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc146E9Q9F7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc146E9Q9F7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc146E9Q9F7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc146E9Q9F7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc146E9Q9F7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc146E9Q9F7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc146E9Q9F7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc146E9Q9F7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc146E9Q9F7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc146E9Q9F7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc146E9Q9F7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc146E9Q9F7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc146E9Q9F7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc146E9Q9F7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc146E9Q9F7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc146E9Q9F7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc146E9Q9F7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc146E9Q9F7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc146E9Q9F7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc146E9Q9F7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms