Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
ApobE9Q414 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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