Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
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