Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrp3E9Q1T6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrp3E9Q1T6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrp3E9Q1T6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrp3E9Q1T6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrp3E9Q1T6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrp3E9Q1T6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrp3E9Q1T6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrp3E9Q1T6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrp3E9Q1T6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrp3E9Q1T6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrp3E9Q1T6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrp3E9Q1T6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrp3E9Q1T6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrp3E9Q1T6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrp3E9Q1T6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrp3E9Q1T6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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