Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm9972E9Q053 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm9972E9Q053 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm9972E9Q053 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm9972E9Q053 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm9972E9Q053 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm9972E9Q053 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm9972E9Q053 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm9972E9Q053 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm9972E9Q053 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm9972E9Q053 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm9972E9Q053 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm9972E9Q053 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm9972E9Q053 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm9972E9Q053 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm9972E9Q053 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm9972E9Q053 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm9972E9Q053 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms