Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Brd1E9PZ26 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Brd1E9PZ26 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Brd1E9PZ26 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Brd1E9PZ26 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Brd1E9PZ26 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Brd1E9PZ26 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brd1E9PZ26 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Brd1E9PZ26 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brd1E9PZ26 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brd1E9PZ26 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brd1E9PZ26 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brd1E9PZ26 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brd1E9PZ26 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brd1E9PZ26 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brd1E9PZ26 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brd1E9PZ26 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brd1E9PZ26 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brd1E9PZ26 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brd1E9PZ26 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brd1E9PZ26 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brd1E9PZ26 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brd1E9PZ26 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Brd1E9PZ26 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Brd1E9PZ26 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Brd1E9PZ26 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Brd1E9PZ26 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Brd1E9PZ26 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Brd1E9PZ26 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Brd1E9PZ26 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Brd1E9PZ26 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Brd1E9PZ26 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Brd1E9PZ26 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Brd1E9PZ26 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Brd1E9PZ26 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Brd1E9PZ26 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Brd1E9PZ26 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Brd1E9PZ26 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Brd1E9PZ26 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Brd1E9PZ26 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Brd1E9PZ26 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Brd1E9PZ26 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Brd1E9PZ26 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Brd1E9PZ26 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brd1E9PZ26 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brd1E9PZ26 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brd1E9PZ26 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brd1E9PZ26 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brd1E9PZ26 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brd1E9PZ26 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brd1E9PZ26 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brd1E9PZ26 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brd1E9PZ26 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brd1E9PZ26 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brd1E9PZ26 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brd1E9PZ26 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brd1E9PZ26 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brd1E9PZ26 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brd1E9PZ26 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brd1E9PZ26 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brd1E9PZ26 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brd1E9PZ26 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brd1E9PZ26 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brd1E9PZ26 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brd1E9PZ26 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brd1E9PZ26 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brd1E9PZ26 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brd1E9PZ26 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brd1E9PZ26 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brd1E9PZ26 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brd1E9PZ26 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brd1E9PZ26 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Brd1E9PZ26 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brd1E9PZ26 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Brd1E9PZ26 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brd1E9PZ26 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brd1E9PZ26 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Brd1E9PZ26 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Brd1E9PZ26 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brd1E9PZ26 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brd1E9PZ26 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brd1E9PZ26 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brd1E9PZ26 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brd1E9PZ26 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brd1E9PZ26 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brd1E9PZ26 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brd1E9PZ26 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brd1E9PZ26 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Brd1E9PZ26 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Brd1E9PZ26 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Brd1E9PZ26 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Brd1E9PZ26 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Brd1E9PZ26 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brd1E9PZ26 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brd1E9PZ26 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brd1E9PZ26 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brd1E9PZ26 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brd1E9PZ26 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brd1E9PZ26 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brd1E9PZ26 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms