Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim30bE9PVL6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim30bE9PVL6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim30bE9PVL6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim30bE9PVL6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim30bE9PVL6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim30bE9PVL6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim30bE9PVL6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim30bE9PVL6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim30bE9PVL6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim30bE9PVL6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim30bE9PVL6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim30bE9PVL6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim30bE9PVL6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim30bE9PVL6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim30bE9PVL6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim30bE9PVL6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim30bE9PVL6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim30bE9PVL6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim30bE9PVL6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim30bE9PVL6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim30bE9PVL6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim30bE9PVL6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim30bE9PVL6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim30bE9PVL6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim30bE9PVL6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim30bE9PVL6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim30bE9PVL6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim30bE9PVL6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim30bE9PVL6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim30bE9PVL6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim30bE9PVL6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim30bE9PVL6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim30bE9PVL6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim30bE9PVL6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim30bE9PVL6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim30bE9PVL6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim30bE9PVL6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim30bE9PVL6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim30bE9PVL6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim30bE9PVL6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim30bE9PVL6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim30bE9PVL6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim30bE9PVL6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim30bE9PVL6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim30bE9PVL6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trim30bE9PVL6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trim30bE9PVL6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim30bE9PVL6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim30bE9PVL6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim30bE9PVL6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim30bE9PVL6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim30bE9PVL6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim30bE9PVL6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim30bE9PVL6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim30bE9PVL6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim30bE9PVL6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim30bE9PVL6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim30bE9PVL6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim30bE9PVL6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim30bE9PVL6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim30bE9PVL6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim30bE9PVL6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim30bE9PVL6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim30bE9PVL6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim30bE9PVL6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim30bE9PVL6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim30bE9PVL6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim30bE9PVL6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim30bE9PVL6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim30bE9PVL6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim30bE9PVL6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim30bE9PVL6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim30bE9PVL6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim30bE9PVL6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim30bE9PVL6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim30bE9PVL6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim30bE9PVL6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim30bE9PVL6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim30bE9PVL6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim30bE9PVL6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim30bE9PVL6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim30bE9PVL6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim30bE9PVL6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim30bE9PVL6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim30bE9PVL6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim30bE9PVL6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim30bE9PVL6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim30bE9PVL6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim30bE9PVL6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim30bE9PVL6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim30bE9PVL6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim30bE9PVL6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim30bE9PVL6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim30bE9PVL6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim30bE9PVL6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Trim30bE9PVL6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim30bE9PVL6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim30bE9PVL6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim30bE9PVL6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms