Protein–RNA interactions for Protein: E9PVJ0

Gm2956, Predicted gene 2956, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2956E9PVJ0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm2956E9PVJ0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm2956E9PVJ0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm2956E9PVJ0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm2956E9PVJ0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm2956E9PVJ0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm2956E9PVJ0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm2956E9PVJ0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm2956E9PVJ0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm2956E9PVJ0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm2956E9PVJ0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm2956E9PVJ0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm2956E9PVJ0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm2956E9PVJ0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm2956E9PVJ0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm2956E9PVJ0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm2956E9PVJ0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm2956E9PVJ0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm2956E9PVJ0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm2956E9PVJ0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm2956E9PVJ0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm2956E9PVJ0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm2956E9PVJ0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm2956E9PVJ0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm2956E9PVJ0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm2956E9PVJ0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm2956E9PVJ0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm2956E9PVJ0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm2956E9PVJ0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm2956E9PVJ0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm2956E9PVJ0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm2956E9PVJ0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm2956E9PVJ0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm2956E9PVJ0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm2956E9PVJ0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm2956E9PVJ0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm2956E9PVJ0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm2956E9PVJ0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm2956E9PVJ0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm2956E9PVJ0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm2956E9PVJ0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms