Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc62E9PVD1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc62E9PVD1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc62E9PVD1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc62E9PVD1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc62E9PVD1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc62E9PVD1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc62E9PVD1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc62E9PVD1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc62E9PVD1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc62E9PVD1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc62E9PVD1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc62E9PVD1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc62E9PVD1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc62E9PVD1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc62E9PVD1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc62E9PVD1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc62E9PVD1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc62E9PVD1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc62E9PVD1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc62E9PVD1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc62E9PVD1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc62E9PVD1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc62E9PVD1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc62E9PVD1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc62E9PVD1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc62E9PVD1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc62E9PVD1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc62E9PVD1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc62E9PVD1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc62E9PVD1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc62E9PVD1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc62E9PVD1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc62E9PVD1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc62E9PVD1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc62E9PVD1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc62E9PVD1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc62E9PVD1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc62E9PVD1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc62E9PVD1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc62E9PVD1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc62E9PVD1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc62E9PVD1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc62E9PVD1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc62E9PVD1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc62E9PVD1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc62E9PVD1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc62E9PVD1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc62E9PVD1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc62E9PVD1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc62E9PVD1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc62E9PVD1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc62E9PVD1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc62E9PVD1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc62E9PVD1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc62E9PVD1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc62E9PVD1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc62E9PVD1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc62E9PVD1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc62E9PVD1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms