Protein–RNA interactions for Protein: E9PV04

Gm8994, Predicted gene 8994, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8994E9PV04 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8994E9PV04 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8994E9PV04 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8994E9PV04 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8994E9PV04 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8994E9PV04 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8994E9PV04 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8994E9PV04 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8994E9PV04 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8994E9PV04 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8994E9PV04 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8994E9PV04 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8994E9PV04 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8994E9PV04 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm8994E9PV04 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm8994E9PV04 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm8994E9PV04 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm8994E9PV04 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm8994E9PV04 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm8994E9PV04 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm8994E9PV04 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm8994E9PV04 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm8994E9PV04 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm8994E9PV04 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm8994E9PV04 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm8994E9PV04 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm8994E9PV04 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm8994E9PV04 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm8994E9PV04 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm8994E9PV04 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms