Protein–RNA interactions for Protein: E0CXC6

4930558K02Rik, RIKEN cDNA 4930558K02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930558K02RikE0CXC6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
4930558K02RikE0CXC6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
4930558K02RikE0CXC6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
4930558K02RikE0CXC6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
4930558K02RikE0CXC6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
4930558K02RikE0CXC6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
4930558K02RikE0CXC6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4930558K02RikE0CXC6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
4930558K02RikE0CXC6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4930558K02RikE0CXC6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4930558K02RikE0CXC6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4930558K02RikE0CXC6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4930558K02RikE0CXC6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4930558K02RikE0CXC6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930558K02RikE0CXC6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930558K02RikE0CXC6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930558K02RikE0CXC6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930558K02RikE0CXC6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930558K02RikE0CXC6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930558K02RikE0CXC6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930558K02RikE0CXC6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930558K02RikE0CXC6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930558K02RikE0CXC6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930558K02RikE0CXC6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930558K02RikE0CXC6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930558K02RikE0CXC6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930558K02RikE0CXC6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930558K02RikE0CXC6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930558K02RikE0CXC6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930558K02RikE0CXC6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930558K02RikE0CXC6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930558K02RikE0CXC6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930558K02RikE0CXC6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930558K02RikE0CXC6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930558K02RikE0CXC6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930558K02RikE0CXC6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930558K02RikE0CXC6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930558K02RikE0CXC6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930558K02RikE0CXC6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930558K02RikE0CXC6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930558K02RikE0CXC6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930558K02RikE0CXC6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930558K02RikE0CXC6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930558K02RikE0CXC6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930558K02RikE0CXC6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930558K02RikE0CXC6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930558K02RikE0CXC6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930558K02RikE0CXC6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
4930558K02RikE0CXC6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930558K02RikE0CXC6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930558K02RikE0CXC6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
4930558K02RikE0CXC6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
4930558K02RikE0CXC6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
4930558K02RikE0CXC6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
4930558K02RikE0CXC6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
4930558K02RikE0CXC6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
4930558K02RikE0CXC6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
4930558K02RikE0CXC6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930558K02RikE0CXC6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms