Protein–RNA interactions for Protein: D3Z257

Gm5930, Predicted gene 5930, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5930D3Z257 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm5930D3Z257 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm5930D3Z257 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm5930D3Z257 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm5930D3Z257 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm5930D3Z257 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm5930D3Z257 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm5930D3Z257 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm5930D3Z257 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm5930D3Z257 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm5930D3Z257 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm5930D3Z257 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm5930D3Z257 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm5930D3Z257 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm5930D3Z257 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm5930D3Z257 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm5930D3Z257 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm5930D3Z257 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm5930D3Z257 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm5930D3Z257 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm5930D3Z257 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm5930D3Z257 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm5930D3Z257 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm5930D3Z257 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm5930D3Z257 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm5930D3Z257 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm5930D3Z257 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm5930D3Z257 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm5930D3Z257 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm5930D3Z257 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm5930D3Z257 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm5930D3Z257 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm5930D3Z257 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm5930D3Z257 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm5930D3Z257 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm5930D3Z257 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm5930D3Z257 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm5930D3Z257 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm5930D3Z257 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm5930D3Z257 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm5930D3Z257 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm5930D3Z257 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm5930D3Z257 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms