Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1P8

4930467E23Rik, RIKEN cDNA 4930467E23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930467E23RikD3Z1P8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930467E23RikD3Z1P8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
4930467E23RikD3Z1P8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930467E23RikD3Z1P8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930467E23RikD3Z1P8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930467E23RikD3Z1P8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
4930467E23RikD3Z1P8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930467E23RikD3Z1P8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930467E23RikD3Z1P8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930467E23RikD3Z1P8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930467E23RikD3Z1P8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930467E23RikD3Z1P8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930467E23RikD3Z1P8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930467E23RikD3Z1P8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930467E23RikD3Z1P8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930467E23RikD3Z1P8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930467E23RikD3Z1P8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms