Protein–RNA interactions for Protein: D3YYZ1

Ldlrad1, Low density lipoprotein receptor class A domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldlrad1D3YYZ1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ldlrad1D3YYZ1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ldlrad1D3YYZ1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ldlrad1D3YYZ1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ldlrad1D3YYZ1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ldlrad1D3YYZ1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ldlrad1D3YYZ1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ldlrad1D3YYZ1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ldlrad1D3YYZ1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ldlrad1D3YYZ1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ldlrad1D3YYZ1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ldlrad1D3YYZ1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ldlrad1D3YYZ1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ldlrad1D3YYZ1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ldlrad1D3YYZ1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ldlrad1D3YYZ1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ldlrad1D3YYZ1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ldlrad1D3YYZ1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ldlrad1D3YYZ1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ldlrad1D3YYZ1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ldlrad1D3YYZ1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ldlrad1D3YYZ1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ldlrad1D3YYZ1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ldlrad1D3YYZ1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ldlrad1D3YYZ1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ldlrad1D3YYZ1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ldlrad1D3YYZ1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ldlrad1D3YYZ1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ldlrad1D3YYZ1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ldlrad1D3YYZ1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ldlrad1D3YYZ1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ldlrad1D3YYZ1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ldlrad1D3YYZ1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ldlrad1D3YYZ1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ldlrad1D3YYZ1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ldlrad1D3YYZ1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ldlrad1D3YYZ1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ldlrad1D3YYZ1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ldlrad1D3YYZ1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ldlrad1D3YYZ1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ldlrad1D3YYZ1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ldlrad1D3YYZ1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ldlrad1D3YYZ1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ldlrad1D3YYZ1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ldlrad1D3YYZ1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ldlrad1D3YYZ1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ldlrad1D3YYZ1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ldlrad1D3YYZ1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ldlrad1D3YYZ1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ldlrad1D3YYZ1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ldlrad1D3YYZ1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ldlrad1D3YYZ1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ldlrad1D3YYZ1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ldlrad1D3YYZ1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ldlrad1D3YYZ1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ldlrad1D3YYZ1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ldlrad1D3YYZ1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ldlrad1D3YYZ1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ldlrad1D3YYZ1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ldlrad1D3YYZ1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ldlrad1D3YYZ1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ldlrad1D3YYZ1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ldlrad1D3YYZ1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ldlrad1D3YYZ1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ldlrad1D3YYZ1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ldlrad1D3YYZ1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ldlrad1D3YYZ1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ldlrad1D3YYZ1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ldlrad1D3YYZ1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ldlrad1D3YYZ1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ldlrad1D3YYZ1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ldlrad1D3YYZ1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ldlrad1D3YYZ1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ldlrad1D3YYZ1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ldlrad1D3YYZ1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ldlrad1D3YYZ1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ldlrad1D3YYZ1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ldlrad1D3YYZ1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ldlrad1D3YYZ1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ldlrad1D3YYZ1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ldlrad1D3YYZ1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ldlrad1D3YYZ1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ldlrad1D3YYZ1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ldlrad1D3YYZ1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ldlrad1D3YYZ1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ldlrad1D3YYZ1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ldlrad1D3YYZ1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ldlrad1D3YYZ1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ldlrad1D3YYZ1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ldlrad1D3YYZ1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ldlrad1D3YYZ1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ldlrad1D3YYZ1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ldlrad1D3YYZ1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ldlrad1D3YYZ1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ldlrad1D3YYZ1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ldlrad1D3YYZ1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ldlrad1D3YYZ1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ldlrad1D3YYZ1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ldlrad1D3YYZ1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ldlrad1D3YYZ1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms