Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Samd1D3YXK1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms