Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rexo5D3YW29 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rexo5D3YW29 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rexo5D3YW29 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rexo5D3YW29 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rexo5D3YW29 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rexo5D3YW29 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rexo5D3YW29 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rexo5D3YW29 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rexo5D3YW29 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rexo5D3YW29 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rexo5D3YW29 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rexo5D3YW29 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rexo5D3YW29 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rexo5D3YW29 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rexo5D3YW29 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rexo5D3YW29 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rexo5D3YW29 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rexo5D3YW29 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rexo5D3YW29 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rexo5D3YW29 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rexo5D3YW29 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rexo5D3YW29 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rexo5D3YW29 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rexo5D3YW29 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rexo5D3YW29 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rexo5D3YW29 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rexo5D3YW29 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rexo5D3YW29 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rexo5D3YW29 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rexo5D3YW29 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rexo5D3YW29 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rexo5D3YW29 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rexo5D3YW29 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rexo5D3YW29 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rexo5D3YW29 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rexo5D3YW29 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rexo5D3YW29 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rexo5D3YW29 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rexo5D3YW29 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rexo5D3YW29 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rexo5D3YW29 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rexo5D3YW29 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Rexo5D3YW29 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rexo5D3YW29 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rexo5D3YW29 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rexo5D3YW29 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rexo5D3YW29 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rexo5D3YW29 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Rexo5D3YW29 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rexo5D3YW29 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rexo5D3YW29 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rexo5D3YW29 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rexo5D3YW29 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rexo5D3YW29 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rexo5D3YW29 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rexo5D3YW29 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rexo5D3YW29 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rexo5D3YW29 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rexo5D3YW29 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rexo5D3YW29 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rexo5D3YW29 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rexo5D3YW29 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rexo5D3YW29 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rexo5D3YW29 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rexo5D3YW29 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rexo5D3YW29 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rexo5D3YW29 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rexo5D3YW29 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rexo5D3YW29 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rexo5D3YW29 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rexo5D3YW29 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rexo5D3YW29 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rexo5D3YW29 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rexo5D3YW29 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rexo5D3YW29 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rexo5D3YW29 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rexo5D3YW29 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rexo5D3YW29 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rexo5D3YW29 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rexo5D3YW29 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rexo5D3YW29 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rexo5D3YW29 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rexo5D3YW29 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rexo5D3YW29 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rexo5D3YW29 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rexo5D3YW29 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rexo5D3YW29 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rexo5D3YW29 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rexo5D3YW29 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rexo5D3YW29 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rexo5D3YW29 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rexo5D3YW29 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Rexo5D3YW29 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rexo5D3YW29 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rexo5D3YW29 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms