Protein–RNA interactions for Protein: C3VPR6

Nlrc5, Protein NLRC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc5C3VPR6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrc5C3VPR6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrc5C3VPR6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrc5C3VPR6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrc5C3VPR6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrc5C3VPR6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrc5C3VPR6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrc5C3VPR6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrc5C3VPR6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrc5C3VPR6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrc5C3VPR6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrc5C3VPR6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrc5C3VPR6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrc5C3VPR6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrc5C3VPR6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrc5C3VPR6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrc5C3VPR6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrc5C3VPR6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrc5C3VPR6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrc5C3VPR6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrc5C3VPR6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrc5C3VPR6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrc5C3VPR6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrc5C3VPR6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrc5C3VPR6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrc5C3VPR6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrc5C3VPR6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrc5C3VPR6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Nlrc5C3VPR6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Nlrc5C3VPR6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nlrc5C3VPR6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nlrc5C3VPR6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nlrc5C3VPR6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nlrc5C3VPR6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Nlrc5C3VPR6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nlrc5C3VPR6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nlrc5C3VPR6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nlrc5C3VPR6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nlrc5C3VPR6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Nlrc5C3VPR6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nlrc5C3VPR6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Nlrc5C3VPR6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nlrc5C3VPR6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nlrc5C3VPR6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nlrc5C3VPR6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nlrc5C3VPR6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nlrc5C3VPR6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nlrc5C3VPR6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nlrc5C3VPR6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nlrc5C3VPR6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nlrc5C3VPR6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nlrc5C3VPR6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nlrc5C3VPR6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nlrc5C3VPR6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlrc5C3VPR6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlrc5C3VPR6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlrc5C3VPR6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlrc5C3VPR6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlrc5C3VPR6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlrc5C3VPR6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlrc5C3VPR6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlrc5C3VPR6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlrc5C3VPR6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlrc5C3VPR6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlrc5C3VPR6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlrc5C3VPR6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlrc5C3VPR6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlrc5C3VPR6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlrc5C3VPR6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlrc5C3VPR6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nlrc5C3VPR6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nlrc5C3VPR6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nlrc5C3VPR6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nlrc5C3VPR6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nlrc5C3VPR6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nlrc5C3VPR6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlrc5C3VPR6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlrc5C3VPR6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlrc5C3VPR6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlrc5C3VPR6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlrc5C3VPR6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlrc5C3VPR6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlrc5C3VPR6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlrc5C3VPR6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlrc5C3VPR6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlrc5C3VPR6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlrc5C3VPR6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlrc5C3VPR6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlrc5C3VPR6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlrc5C3VPR6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlrc5C3VPR6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlrc5C3VPR6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlrc5C3VPR6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlrc5C3VPR6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlrc5C3VPR6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlrc5C3VPR6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlrc5C3VPR6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlrc5C3VPR6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlrc5C3VPR6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nlrc5C3VPR6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms