Protein–RNA interactions for Protein: B9EKX1

Ptchd4, Patched domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 904 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptchd4B9EKX1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ptchd4B9EKX1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ptchd4B9EKX1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ptchd4B9EKX1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ptchd4B9EKX1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptchd4B9EKX1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptchd4B9EKX1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptchd4B9EKX1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptchd4B9EKX1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptchd4B9EKX1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptchd4B9EKX1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptchd4B9EKX1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptchd4B9EKX1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptchd4B9EKX1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptchd4B9EKX1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ptchd4B9EKX1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ptchd4B9EKX1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ptchd4B9EKX1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ptchd4B9EKX1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ptchd4B9EKX1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ptchd4B9EKX1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ptchd4B9EKX1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ptchd4B9EKX1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ptchd4B9EKX1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ptchd4B9EKX1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ptchd4B9EKX1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ptchd4B9EKX1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptchd4B9EKX1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptchd4B9EKX1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptchd4B9EKX1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptchd4B9EKX1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptchd4B9EKX1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptchd4B9EKX1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptchd4B9EKX1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptchd4B9EKX1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptchd4B9EKX1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptchd4B9EKX1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ptchd4B9EKX1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ptchd4B9EKX1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ptchd4B9EKX1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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