Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC6

Polr3a, DNA-directed RNA polymerase subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3aB2RXC6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Polr3aB2RXC6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Polr3aB2RXC6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Polr3aB2RXC6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Polr3aB2RXC6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Polr3aB2RXC6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Polr3aB2RXC6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Polr3aB2RXC6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Polr3aB2RXC6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Polr3aB2RXC6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Polr3aB2RXC6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Polr3aB2RXC6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Polr3aB2RXC6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Polr3aB2RXC6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Polr3aB2RXC6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Polr3aB2RXC6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Polr3aB2RXC6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Polr3aB2RXC6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Polr3aB2RXC6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Polr3aB2RXC6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Polr3aB2RXC6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Polr3aB2RXC6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Polr3aB2RXC6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Polr3aB2RXC6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Polr3aB2RXC6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Polr3aB2RXC6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Polr3aB2RXC6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Polr3aB2RXC6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Polr3aB2RXC6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Polr3aB2RXC6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Polr3aB2RXC6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Polr3aB2RXC6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Polr3aB2RXC6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Polr3aB2RXC6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Polr3aB2RXC6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Polr3aB2RXC6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Polr3aB2RXC6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Polr3aB2RXC6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Polr3aB2RXC6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Polr3aB2RXC6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Polr3aB2RXC6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Polr3aB2RXC6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Polr3aB2RXC6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Polr3aB2RXC6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Polr3aB2RXC6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Polr3aB2RXC6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Polr3aB2RXC6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Polr3aB2RXC6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Polr3aB2RXC6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Polr3aB2RXC6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Polr3aB2RXC6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Polr3aB2RXC6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Polr3aB2RXC6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Polr3aB2RXC6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Polr3aB2RXC6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Polr3aB2RXC6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Polr3aB2RXC6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Polr3aB2RXC6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Polr3aB2RXC6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Polr3aB2RXC6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Polr3aB2RXC6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Polr3aB2RXC6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Polr3aB2RXC6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Polr3aB2RXC6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Polr3aB2RXC6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Polr3aB2RXC6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Polr3aB2RXC6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Polr3aB2RXC6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Polr3aB2RXC6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Polr3aB2RXC6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Polr3aB2RXC6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Polr3aB2RXC6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Polr3aB2RXC6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Polr3aB2RXC6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Polr3aB2RXC6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Polr3aB2RXC6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Polr3aB2RXC6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Polr3aB2RXC6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Polr3aB2RXC6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Polr3aB2RXC6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Polr3aB2RXC6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Polr3aB2RXC6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Polr3aB2RXC6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Polr3aB2RXC6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Polr3aB2RXC6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Polr3aB2RXC6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Polr3aB2RXC6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Polr3aB2RXC6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Polr3aB2RXC6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Polr3aB2RXC6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Polr3aB2RXC6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Polr3aB2RXC6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Polr3aB2RXC6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Polr3aB2RXC6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Polr3aB2RXC6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Polr3aB2RXC6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Polr3aB2RXC6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Polr3aB2RXC6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Polr3aB2RXC6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Polr3aB2RXC6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms