Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC1

Trappc11, Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11B2RXC1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc11B2RXC1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc11B2RXC1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc11B2RXC1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc11B2RXC1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc11B2RXC1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc11B2RXC1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc11B2RXC1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc11B2RXC1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc11B2RXC1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc11B2RXC1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc11B2RXC1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc11B2RXC1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc11B2RXC1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc11B2RXC1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc11B2RXC1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trappc11B2RXC1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trappc11B2RXC1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc11B2RXC1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc11B2RXC1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc11B2RXC1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc11B2RXC1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc11B2RXC1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc11B2RXC1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc11B2RXC1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc11B2RXC1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc11B2RXC1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc11B2RXC1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc11B2RXC1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc11B2RXC1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc11B2RXC1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc11B2RXC1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc11B2RXC1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc11B2RXC1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc11B2RXC1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc11B2RXC1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc11B2RXC1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc11B2RXC1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc11B2RXC1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc11B2RXC1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc11B2RXC1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc11B2RXC1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc11B2RXC1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc11B2RXC1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc11B2RXC1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc11B2RXC1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc11B2RXC1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc11B2RXC1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc11B2RXC1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc11B2RXC1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc11B2RXC1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc11B2RXC1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc11B2RXC1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc11B2RXC1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc11B2RXC1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc11B2RXC1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc11B2RXC1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc11B2RXC1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc11B2RXC1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc11B2RXC1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc11B2RXC1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc11B2RXC1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc11B2RXC1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc11B2RXC1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc11B2RXC1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc11B2RXC1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc11B2RXC1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc11B2RXC1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc11B2RXC1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc11B2RXC1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc11B2RXC1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc11B2RXC1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc11B2RXC1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc11B2RXC1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc11B2RXC1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc11B2RXC1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc11B2RXC1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trappc11B2RXC1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc11B2RXC1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc11B2RXC1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc11B2RXC1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc11B2RXC1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc11B2RXC1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc11B2RXC1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc11B2RXC1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc11B2RXC1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc11B2RXC1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc11B2RXC1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc11B2RXC1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc11B2RXC1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc11B2RXC1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc11B2RXC1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc11B2RXC1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc11B2RXC1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc11B2RXC1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc11B2RXC1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc11B2RXC1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc11B2RXC1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc11B2RXC1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc11B2RXC1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms