Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rrn3B2RS91 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rrn3B2RS91 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
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