Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rrn3B2RS91 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rrn3B2RS91 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rrn3B2RS91 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms