Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf518bB2RRE4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf518bB2RRE4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf518bB2RRE4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf518bB2RRE4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf518bB2RRE4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf518bB2RRE4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf518bB2RRE4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf518bB2RRE4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf518bB2RRE4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf518bB2RRE4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf518bB2RRE4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf518bB2RRE4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Znf518bB2RRE4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Znf518bB2RRE4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Znf518bB2RRE4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Znf518bB2RRE4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Znf518bB2RRE4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Znf518bB2RRE4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Znf518bB2RRE4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Znf518bB2RRE4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Znf518bB2RRE4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Znf518bB2RRE4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf518bB2RRE4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms