Protein–RNA interactions for Protein: B1AY10

Nfx1, Transcriptional repressor NF-X1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfx1B1AY10 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nfx1B1AY10 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nfx1B1AY10 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nfx1B1AY10 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nfx1B1AY10 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nfx1B1AY10 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Nfx1B1AY10 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nfx1B1AY10 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nfx1B1AY10 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nfx1B1AY10 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nfx1B1AY10 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nfx1B1AY10 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nfx1B1AY10 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nfx1B1AY10 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nfx1B1AY10 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nfx1B1AY10 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nfx1B1AY10 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nfx1B1AY10 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nfx1B1AY10 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nfx1B1AY10 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nfx1B1AY10 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nfx1B1AY10 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nfx1B1AY10 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nfx1B1AY10 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nfx1B1AY10 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nfx1B1AY10 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nfx1B1AY10 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nfx1B1AY10 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nfx1B1AY10 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nfx1B1AY10 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nfx1B1AY10 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nfx1B1AY10 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nfx1B1AY10 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nfx1B1AY10 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Nfx1B1AY10 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nfx1B1AY10 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nfx1B1AY10 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nfx1B1AY10 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nfx1B1AY10 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nfx1B1AY10 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nfx1B1AY10 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nfx1B1AY10 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nfx1B1AY10 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nfx1B1AY10 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nfx1B1AY10 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nfx1B1AY10 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nfx1B1AY10 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nfx1B1AY10 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nfx1B1AY10 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nfx1B1AY10 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nfx1B1AY10 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nfx1B1AY10 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nfx1B1AY10 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nfx1B1AY10 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nfx1B1AY10 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nfx1B1AY10 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nfx1B1AY10 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nfx1B1AY10 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Nfx1B1AY10 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nfx1B1AY10 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nfx1B1AY10 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nfx1B1AY10 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nfx1B1AY10 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nfx1B1AY10 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nfx1B1AY10 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nfx1B1AY10 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nfx1B1AY10 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nfx1B1AY10 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nfx1B1AY10 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nfx1B1AY10 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nfx1B1AY10 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nfx1B1AY10 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nfx1B1AY10 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nfx1B1AY10 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nfx1B1AY10 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nfx1B1AY10 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nfx1B1AY10 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nfx1B1AY10 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nfx1B1AY10 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nfx1B1AY10 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nfx1B1AY10 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nfx1B1AY10 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nfx1B1AY10 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nfx1B1AY10 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nfx1B1AY10 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nfx1B1AY10 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nfx1B1AY10 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nfx1B1AY10 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nfx1B1AY10 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nfx1B1AY10 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nfx1B1AY10 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nfx1B1AY10 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nfx1B1AY10 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nfx1B1AY10 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nfx1B1AY10 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nfx1B1AY10 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nfx1B1AY10 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nfx1B1AY10 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nfx1B1AY10 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nfx1B1AY10 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms