Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB3

Gm438, MCG65768, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm438B1ASB3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm438B1ASB3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms